导语：在肿瘤领域，结直肠癌(CC)的异质性给治疗带来诸多挑战，尤其是III期CC，缺乏有效的生物标志物指导治疗决策。目前，临床实践中仅依据T和N分期以及II期CC的高危因素来指导术后治疗，虽有多种预后生物标志物被提出，如分子因素(dMMR/微卫星不稳定状态、RAS和BRAF突变)、病理数据(免疫评分)和转录组分类(四个共识分子亚型)等，但仍无法精准预测复发风险。

        近年来，肿瘤微环境(TME)的基因组特征在多种癌症分层中展现出潜力，其中CXCL13、M2巨噬细胞等相关特征与CC预后关联备受关注。同时，3’RNA测序技术的发展为研究肿瘤的基质和免疫特征提供了新途径。2025年1月，Journal of Clinical Oncology发表了一篇题为 “Prognostic Models From Transcriptomic Signatures of the Tumor Microenvironment and Cell Cycle in Stage III Colon Cancer From PETACC-8 and IDEA-France Trials” 的文章，研究聚焦于利用TME和细胞周期的转录组特征构建III期CC预后模型，为精准治疗带来新的可能。

         如何构建肠癌预后模型?巧用转录组特征与多队列研究

        本研究是一项基于PETACC-8和IDEA-France两项III期随机试验的研究，旨在构建基于肿瘤微环境(TME)和细胞周期转录组特征的III期结肠癌(CC)预后模型。在样本纳入筛选方面，PETACC-8试验共2550例患者，其中2043例签署了试验和转化研究知情同意书，最终1733例患者的肿瘤样本可用于RNA提取及3’RNA测序;IDEA-France试验有2010例患者，1693例签署相关同意书，1248例患者样本符合测序要求。实验未进行额外分组，而是对样本进行多种分析。干预措施主要是对肿瘤RNA进行提取和测序，PETACC-8试验用QIAsymphony RNA试剂盒从宏观解剖的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织切片提取RNA，IDEA-France试验用RNeasy FFPE试剂盒从FFPE打孔活检样本提取。主要评价指标为无复发生存期(TTR)，定义为从随机分组到局部和/或远处复发和/或因CC死亡的时间;次要评价指标包括分析不同转录组特征分数与患者特征的关系等。

 图1. 试验流程图

        转录组特征能否预测肠癌复发?关键数据给出答案

        研究结果显示，高Oncotype-like和M2评分、低CXCL13表达和T细胞评分与较短的TTR相关。在PETACC-8训练队列中，这四个评分单独作为协变量时均能预测TTR。简单预后模型中，这些特征相互补充，展现出额外的预后价值。构建的扩展预后模型C指数达0.727，根据该模型四分位数分组，患者3年TTR率差异显著，如PETACC-8队列中第一四分位数患者3年TTR率为94%，第四四分位数仅为53%。

图2. 根据PETACC-8和IDEA-France队列中简单/扩展预后模型值的四分位数绘制的无复发生存期(TTR)的Kaplan-Meier曲线

 图3. 根据PETACC-8和IDEA-France队列中免疫增殖基质(IPS)评分绘制的无复发生存期(TTR)的Kaplan-Meier曲线

        免疫增殖基质(IPS)评分也与TTR显著相关，多变量分析表明，IPS评分越高，TTR越短，在PETACC-8和IDEA-France队列中，IPS评分4分的患者3年TTR率分别为57%和61%，而IPS评分0分的患者则高达93%和90%。在IDEA-France队列中，结合术后循环肿瘤DNA(ctDNA)分析发现，ctDNA阳性且IPS评分3-4的患者3年TTR率仅20%，而ctDNA阴性且IPS评分0-2的患者3年TTR率达86%。作者认为，这些转录组特征能有效分层患者复发风险，为临床决策提供重要依据。

图4. 根据IDEA-France队列中IPS评分和循环肿瘤DNA(ctDNA)绘制的无复发生存期(TTR)的Kaplan-Meier曲线

       总结

        本文利用PETACC-8和IDEA-France试验数据，构建了基于TME和细胞周期转录组特征的预后模型及IPS评分系统。这些模型和评分能在已知预后因素基础上，进一步对III期CC患者复发风险进行分层。研究独特价值在于，通过多队列研究验证了模型和评分的有效性，且使用的3’RNA测序技术可在FFPE组织上进行，未来成本可能降低，具有临床应用潜力。同时，研究发现结合转录组特征和ctDNA结果，比单独使用ctDNA能更精准预测复发，有助于识别不同风险患者，指导辅助化疗决策，如确定哪些高风险临床分期患者可能从延长化疗中获益，哪些低风险患者存在高复发风险需要强化治疗等。不过研究也存在局限，如缺乏无辅助化疗的匹配队列，无法判断化疗疗效预测价值，且RNA测序尚未在临床广泛应用。总体而言，该研究为III期CC个性化治疗提供了重要参考，后续需前瞻性研究进一步验证其临床实用性 。

        参考文献

    Gallois C, Sroussi M, André T, et al. Prognostic Models From Transcriptomic Signatures of the Tumor Microenvironment and Cell Cycle in Stage III Colon Cancer From PETACC-8 and IDEA-France Trials[J]. Journal of Clinical Oncology, 2025: JCO. 23.02262.